هذه قائمة بأعلام إندونيسيا، حيث تضم صورا ومعلومات حول الأعلام الإندونيسية الرسمية المستخدمة والأعلام التاريخية الأخرى.

العلم	التاريخ	الاستخدام	وصف
	17 أغسطس 1945 –	علم إندونيسيا	يحتوي على اللونين الأحمر والأبيض على شكل أفقي
	17 أغسطس 1945 –	علم القوات البحرية الإندونيسية	تسعة خطوط أفقية متساوية من اللونين الأحمر والأبيض بشكل متناوب

• 
  آتشيه
• 
  بالي
• 
  بنتن
• 
  بنغكولو
• 
  يوغياكارتا
• 
  جاكرتا
• 
  غورونتالو
• 
  جمبي
• 
  جاوة الغربية
• 
  جاوة الوسطى
• 
  جاوة الشرقية
• 
  كالمنتان الغربية
• 
  كالمنتان الوسطى
• 
  كالمنتان الشرقية
• 
  كالمنتان الشمالية
• 
  كليمنتان الجنوبية
• 
  بانغكا - بليتونغ
• 
  لامبونغ
• 
  مالوكو
• 
  مالوكو الشمالية
• 
  نوسا تنقارا الغربية
• 
  نوسا تنقارا الشرقية
• 
  بابوا
• 
  بابوا الغربية
• 
  رياو
• 
  جزر رياو
• 
  سولاوسي الجنوبية
• 
  سولاوسي الوسطى
• 
  سولاوسي الجنوبية الشرقية
• 
  سولاوسي الشمالية
• 
  سولاوسي الغربية
• 
  سومطرة الغربية
• 
  سومطرة الجنوبية
• 
  سومطرة الشمالية

• 
  مدينة باندونغ (يشبه علم الغابون)
• 
  مدينة يوغياكارتا

• 
  شرق إندونيسيا (1946–1950)
• 
  باسوندان (1948–1950)
• 
  جنوب سومطرة (1948–1950)
• 
  شرق سومطرة (1947–1950)
• 
  داياك الكبرى (1946–1950)
• 
  شرق جافا/مادورا (1948–1950)

• 
  علم تيمور الشرقية قبل استقلالها عن إندونيسيا

• 
  سلطنة آتشيه
• 
  سلطنة أساهان
• 
  سلطنة بنجر
• 
  سلطنة بنتن
• 
  سلطنة بونتياناك
• 
  مملكة باراغويونغ
• 
  مملكة بالي
• 
  سلطنة غوا
• 
  سلطنة ماتارام
• 
  مانكونيغاران
• 
  سلطنة رياو لينغا (يشبه علم تركيا)
• 
  سلطنة سوراكارتا (يشبه علم النمسا)
• 
  سلطنة بولونجان
• 
  سلطنة سياك سري إندرابورا

• 
  العلم الرئاسي لإندونيسيا^[1]

• 
  حركة آتشيه الحرة
• 
  حركةرياو الحرة
• 
  حركة بابوا الحرة
• 
  مولوكاس الجنوبية
• 
  حركة سيليبس الحرة

• 
  العلم الرسمي للدولة
• 
  العلم الرسمي في الحرب
• 
  العلم الرسمي للجيش