 | هذه مقالة غير مراجعة. (مايو 2022) |
معلوماتية الجينوم ( حاسوبية الجينوم )(أيضًا المعلوماتية الجينية أو معالجة المعلومات الجينية ) [1] هي دراسة علمية لمعالجة المعلومات في الجينوم .
(يتم تطبيق تقنيات الكمبيوتر والإحصاء لاستخلاص المعلومات البيولوجية من تسلسل الجينوم)
المقدمة
تحدث معالجة المعلومات وتدفق المعلومات في غضون تطور الكائن الحي وفي طوال حياته. [2] اساس الحساب هو معالجة المعلومات، اساس معالجة المعلومات البيولوجية هو التحكم في الأحداث الجزيئية التي تحدث داخل الخلية. [3] تقدم معلومات الجينوم تقنيات حسابية وتطبقها لاستخلاص المعلومات من تسلسل الجينوم. [4] تتضمن معلوماتية الجينوم طرقًا لتحليل معلومات سلسلة الحمض النووي والتنبؤ في سلسلة البروتين وبنيته الهيكلية . [4] تتضمن طرق دراسة البيانات الجينومية الكبيرة
1) استدعاء المتغير(استدعاء المتغير هو استنتاج مفاده أن هناك اختلافًا في النوكليوتيدات مقابل بعض الإشارات في موضع معين في جينوم فردي أو نسخة، وغالبًا ما يشار إليها باسم متغير نوكليوتيد مفرد (SNV))
2) تحليل النسخ، 3) تفسير المتغير (تتطلب العثور على العديد من الأفراد مع كل متغير) [5]
يمكن لمعلومات الجينوم تحليل معلومات سلسلة الحمض النووي والتنبؤ في سلسلة البروتين و بنيته الهيكلية. [4] معلوماتية الجينوم تتعامل مع [6] الميكروبات و metagenomics (دراسة المادة الجينية المسترجعة مباشرة من العينات البيئية) ، خوارزميات التسلسل ، الاكتشاف المتنوع وتجميع الجينوم، التطور، الصفات المعقدة وعلم الوراثة، الجينوميات الشخصية والطبية، النسخ، بنية الجينوم ووظيفته. [6] تشير المعلوماتية الجينية إلى ديناميكيات الجينوم والكروموسوم، وعلم الأحياء الكمي والنمذجة، والأمراض الجزيئية والخلوية. [7] تتضمن معلوماتية الجينوم أيضًا مجال تصميم الجينوم. لا يزال هناك الكثير الذي يمكننا القيام به وتطويره في Genome Informatics. البحث عن مرض محتمل، أو البحث عن حل لمرض، أو أثبات سبب اصابة الناس بالأمراض من دون سبب . بالنسبة للمعلوماتية الجينومية، هناك عدة تطبيقات رئيسية لها، منها:
- تحليل معلومات الجينوم [8]
- النمذجة الحاسوبية لشبكات تنظيم الجينات [2]
- نماذج لتسلسلات الحمض النووي التنظيمي المعقدة حقيقية النواة [2]
- خوارزمية للبدأ في الكشف عن عنصر الحمض النووي [2]
التطبيقات
البحث عن الأنظمة الجزيئية الحيوية التي يمكنها معالجة المعلومات للتطبيقات الحسابية، بسبب قدرتها على التوازي والتصغير ولأن توافقها الحيوي (قدرة المادة على الأداء باستجابة مضيفة مناسبة في موقف معين.) يجعلها أيضًا مناسبة للتطبيقات الطبية الحيوية في المستقبل. تم استخدام الحمض النووي لتصميم الآلات والمحركات والأوتوماتا المحدودة ( جهاز الحوسبة المجردة ) والبوابات المنطقية وشبكات التفاعل والبرامج المنطقية، من بين العديد من الهياكل والسلوكيات الديناميكية الأخرى. [9]
انظر أيضا
مراجع
- ^ Patel، A. (2001). "Why genetic information processing could have a quantum basis". Journal of Biosciences. ج. 26 ع. 2: 145–151. arXiv:quant-ph/0105001. Bibcode:2001quant.ph..5001P. DOI:10.1007/BF02703638. ISSN:0250-5991. PMID:11426050. مؤرشف من الأصل في 2021-12-30.
- ^ ا ب ج د Bajic, Vladimir B; Wee, Tan Tin (2005). "Information Processing and Living Systems". Series on Advances in Bioinformatics and Computational Biology (بالإنجليزية). 2. DOI:10.1142/p391. ISBN:978-1-86094-563-2. ISSN:1751-6404. Archived from the original on 2021-05-18.
- ^ Wills، Peter R. (13 مارس 2016). "DNA as information". Philosophical Transactions of the Royal Society A: Mathematical, Physical and Engineering Sciences. ج. 374 ع. 2063: 20150417. Bibcode:2016RSPTA.37450417W. DOI:10.1098/rsta.2015.0417. PMID:26857666. مؤرشف من الأصل في 2021-12-30.
- ^ ا ب ج "Genome informatics - Latest research and news | Nature". www.nature.com. مؤرشف من الأصل في 2022-05-16. اطلع عليه بتاريخ 2020-04-20.
- ^ "Genome Informatics (Virtual Conference)". Wellcome Genome Campus Advanced Courses and Scientific Conferences (بالإنجليزية الأمريكية). Archived from the original on 2021-02-27.
- ^ ا ب "Genome Informatics | CSHL". meetings.cshl.edu. مؤرشف من الأصل في 2021-10-20. اطلع عليه بتاريخ 2020-04-20.
- ^ "ePole of GenoInformatics". www.ijm.fr (بالفرنسية). Archived from the original on 2022-01-08. Retrieved 2020-04-21.
- ^ Human genome informatics : translating genes into health. Lambert, Christophe G., Baker, Darrol J., Patrinos, George P. London, United Kingdom. 2 أغسطس 2018. ISBN:978-0-12-813431-3. OCLC:1047959760. مؤرشف من الأصل في 2021-12-30.
{{استشهاد بكتاب}}: صيانة الاستشهاد: آخرون (link) صيانة الاستشهاد: مكان بدون ناشر (link) - ^ Santini، Cristina Costa؛ Bath، Jonathan؛ Turberfield، Andrew J.؛ Tyrrell، Andy M. (23 أبريل 2012). "A DNA Network as an Information Processing System". International Journal of Molecular Sciences. ج. 13 ع. 4: 5125–5137. DOI:10.3390/ijms13045125. ISSN:1422-0067. PMID:22606034.
{{استشهاد بدورية محكمة}}: الوسيط غير المعروف|PMCID=تم تجاهله يقترح استخدام|pmc=(مساعدة)صيانة الاستشهاد: دوي مجاني غير معلم (link)
